Voir la source de Variants Kappa et Delta du SARS-CoV-2

{{Avertissement Covid-19}}

[[File:B.1.1.617 sequences by country as of 21 April 2021.svg|thumb|upright=1.5|Nombre de séquençages B.1.617 par pays au 21 avril 2021<ref name=Pango/>.
<br>
'''Legend:'''
{{legend|#ee7070|>100 séquences confirmées}}
{{legend|#ffc0c0|2–99 séquences confirmées}}
{{legend|#ffdfe0|1 séquences confirmées}}
{{legend|#e0e0e0|Absence ou absence de donnée}}
]]

Les '''variants B.1.617''', nommés aussi '''G / 452R.''' '''V3'''<ref>{{Lien web |titre=COVID-19 Weekly Epidemiological Update (2 May 2021) |langue=en |url=https://reliefweb.int/sites/reliefweb.int/files/resources/20210504_Weekly_Epi_Update_38.pdf |série=reliefweb.int |éditeur=World Health Organization |consulté le=6 mai 2021}}</ref> et fréquemment surnommés « '''variant indien''' », sont des [[variants du SARS-CoV-2]]. Ils sont identifiés pour la première fois dans le [[Maharashtra]], en [[Inde]]<ref name="GISAID">{{Lien web |auteur=<!--Not stated--> |titre=Tracking of Variants |langue=en |url=https://www.gisaid.org/hcov19-variants/ |série=gisaid.org |éditeur=[[GISAID]] |date=26 avril 2021|consulté le=8 mai 2021}}</ref> le {{date-|5 octobre 2020}}<ref name="SMC1">{{Lien web |titre=Expert reaction to cases of variant B.1.617 (the ‘Indian variant’) being investigated in the UK |langue=en |url=https://www.sciencemediacentre.org/expert-reaction-to-cases-of-variant-b-1-617-the-indian-variant-being-investigated-in-the-uk/ |série=Science Media Centre |éditeur=Science Media Centre |consulté le=20 avril 2021}}</ref>. Ils sont identifiés dans le [[clade]] 20A sous le système de classification [[phylogénétique]] [[Nextstrain]]<ref>{{Lien web |titre=Genomic epidemiology of novel coronavirus - Global subsampling (Filtered to B.1.617) |langue=en |url=https://nextstrain.org/ncov/global?f_emerging_lineage=B.1.617 |série=nextstrain.org |consulté le=05 mai 2021}}</ref>. La sous-lignée B.1.617.1 est nommée '''variant Kappa''' par l'[[Organisation mondiale de la santé|OMS]], et la sous-lignée B.1.617.2, '''variant Delta'''<ref>{{Lien web|langue=fr|url=https://www.liberation.fr/societe/sante/alpha-beta-gamma-loms-rebaptise-les-variants-du-covid-19-20210601_NQITCIFFEZGQJB5STXBGE5LPCI/|titre=Alpha, Bêta, Gamma… L’OMS rebaptise les variants du Covid-19|jour=1|mois=6|année=2021|site=liberation.fr}}.</ref>.

== « Double mutant » ==
Détecté le {{date-|5 octobre 2020}} près de [[Nagpur]] en [[Inde]], le variant B.1.617(.1) présente 15 [[Mutation (génétique)|mutations]] dont deux affectent le [[Domaine de liaison du ligand|domaine de liaison]] de la [[péplomère|protéine spiculaire]] :
* [[Variants du SARS-CoV-2#L452R|L452R]], détectée chez les variants B.1.427/B.1.429 (Californie)<ref name=SPF2021-04-08>{{lien web |url=https://www.santepubliquefrance.fr/media/files/01-maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/infection-a-coronavirus/analyse-de-risque-des-variants-emergents-de-sars-cov-2-08-04-21 |titre=Analyse de risque liée aux variants émergents de SARS-CoV-2 réalisée conjointement par le CNR des virus des infections respiratoires et Santé publique France] |date=8 avril 2021|site=santepubliquefrance.fr}}</ref> ; 
* [[Variants du SARS-CoV-2#E484K et E484Q|E484Q]], affectant le même [[acide aminé]] que la mutation E484K des variants sud-africains et brésiliens<ref>{{Lien web|url=https://www.francetvinfo.fr/sante/maladie/coronavirus/covid-19-ce-que-l-on-sait-du-variant-b-1-617-alors-que-l-inde-affronte-une-flambee-epidemique_4379227.html|titre=Covid-19 : ce que l'on sait du variant B.1.617 identifié en Inde, dont les premiers cas sont signalés en France|date=20 avril 2021|consulté le=17 juillet 2021|éditeur=France info}}</ref>.
Ces deux dernières mutations sont préoccupantes car elles pourraient lui permettre d'échapper aux [[anticorps]] (post-infection ou vaccinaux)<ref name="Pango">{{Lien web |titre=PANGO lineages Lineage B.1.617 |url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.617.html |série=cov-lineages.org |consulté le=3 mai 2021}}</ref>{{,}}<ref name="SGDB">{{Article |auteur1=Starr |prénom1=Tyler N. |auteur2=Greaney |prénom2=Allison J. |auteur3=Dingens |prénom3=Adam S. |auteur4=Bloom |prénom4=Jesse D. |titre=Complete map of SARS-CoV-2 RBD mutations that escape the monoclonal antibody LY-CoV555 and its cocktail with LY-CoV016 |langue=en |périodique=Cell Reports Medicine |date=avril 2021|doi=10.1016/j.xcrm.2021.100255 |accès url=libre|pages=100255 }}</ref>. Elles lui valent le qualificatif {{incise|impropre<ref group="Note" name="Nombre_mutations">Le nombre de mutations n'est pas limité à deux et le virus n'a pas muté deux fois.</ref>}} de « double mutant »<ref>{{Lien web|url=https://www.ouest-france.fr/sante/virus/coronavirus/covid-19-que-sait-on-du-variant-indien-ce-double-mutant-qui-inquiete-315ce14e-a0f0-11eb-b31f-1a909c47a137 Covid-19|titre=Que sait-on du variant indien, ce « double mutant » qui inquiète ?|éditeur=[[Ouest-France]]|date=19 avril 2021|consulté le=17 juillet 2021}}</ref>.

Le {{date-|10 mai 2021}}, ce variant B.1.617 a été classé comme « [[variant préoccupant|préoccupant]] » par l'[[Organisation mondiale de la santé|OMS]]<ref>[https://www.france24.com/fr/asie-pacifique/20210511-covid-19-jug%C3%A9-plus-contagieux-le-variant-indien-class%C3%A9-comme-pr%C3%A9occupant-par-l-oms Covid-19 : jugé "plus contagieux", le variant indien classé comme "préoccupant" par l'OMS]. [[France 24]]</ref>. Le {{date-|11 mai 2021}}, l'OMS note qu'il « pourrait y avoir des différences importantes entre les trois sous-lignées » mais que « les données actuellement disponibles sont trop limitées » pour pouvoir les différencier<ref name=RTL>{{Lien web|url=https://www.rtl.fr/actu/bien-etre/coronavirus-ce-que-l-on-sait-du-variant-indien-7900032456|éditeur=RTL|consulté le=17 juillet 2021|titre=Coronavirus : ce que l'on sait du variant indien|date=17 mai 2021}}</ref>. 

Des cas de [[mucormycose]]<ref group=Note>Voir [[Champignon noir (complication liée à la COVID-19)]]</ref> sont signalés en Inde chez des patients guéris de la Covid-19<ref>[https://www.pourquoidocteur.fr/Articles/Question-d-actu/36286-Covid-Inde-mystere-champignon-noir Covid en Inde : le mystère du « champignon noir »], Pourquoi Docteur.</ref>. Il semblerait toutefois que ce soit la conjonction d'un [[diabète de type 2]]<ref>{{DOI|10.1051/medsci/201329s106}}</ref> et d'un traitement à base de [[corticoïde]]s affaiblissant le [[système immunitaire]] qui favorise l'infection [[mucor]]ale et non le virus [[SARS-CoV-2]] lui-même<ref name=":1">{{Lien web |langue=français |auteur=Cyrielle Cabot |titre=Inde : un "champignon noir", touchant des patients atteints du Covid-19, provoque l'inquiétude |url=https://www.france24.com/fr/asie-pacifique/20210514-inde-un-champignon-noir-touchant-des-patients-atteints-du-covid-19-provoque-l-inqui%C3%A9tude |site=france24.com |date=14 mai 2021|consulté le=14 mai 2021}}</ref>.

Le {{date-|31 mai 2021}}, l'OMS adopte des lettres grecques pour nommer les variants les plus importants, en remplacement de leur origine géographique, potentiellement stigmatisante :
* la lignée B.1.617.1 devient le variant Kappa et est déclassé [[Variants du SARS-CoV-2#Variants d'intérêt (VOI)|variant d’intérêt]] ;
* la lignée B.1.617.2, la plus dynamique, devient le variant Delta, classé [[variant préoccupant]] ;
* la troisième lignée s'est peu répandue hors de l'Inde.

Le variant Delta se déploie en Europe ({{4e}} vague) au détriment du [[Variant Alpha du SARS-CoV-2|variant Alpha]]. Il se caractérise par<ref>{{Lien web|url=https://www.bbc.com/afrique/monde-57792106|éditeur=BBC News Brasil|consulté le=17 juillet 2021|titre=Covid : les mutations qui rendent le variant delta du virus plus contagieux et plus inquiétant|date=12 juillet 2021}}.</ref>{{,}}<ref>{{Article| langue=en| titre=The mutation that helps Delta spread like wildfire| sous-titre=A key amino-acid change might underlie the coronavirus variant’s ferocious infectivity| auteur1=Ewen Callaway| périodique=[[Nature (revue)|Nature]]| volume=596| date=20 août 2021| pages=472-473| doi=10.1038/d41586-021-02275-2| accès url=libre| consulté le=26 août 2021}}.</ref> :
* 2 substitutions dans le domaine de liaison aux récepteurs cellulaires ([[Variants du SARS-CoV-2#L452R|L452R]] et T478K), facilitant la liaison au [[Enzyme de conversion de l'angiotensine 2|récepteur ACE2]] ;
* 1 substitution près du site de clivage S1/S2 par la [[furine]] ([[Variants du SARS-CoV-2#P681H et P681R|P681R]]), facilitant la fusion avec la [[membrane cellulaire]] ;
* 1 substitution (T19R) et 1 double [[délétion]] (157-158del) dans le domaine antigénique [[Extrémité N-terminale|NTD]], contribuant à l'échappement aux [[anticorps neutralisant]]s.

Depuis {{Date-|août 2021}}, les variants Delta ont été subdivisés dans le système de désignation de la lignée Pango en variantes AY.1 à AY.28. Cependant, il n'existe aucune information permettant de savoir si cette classification est corrélée avec des changements dans les caractéristiques biologiques du virus.

À partir d'{{Date-|août 2021}}, AY.4 à AY.11 sont prédominants au Royaume-Uni, AY.12 en Israël, AY.2, AY.3, AY.13, AY.14, AY. 25 aux États-Unis, AY 20 aux États-Unis et au Mexique, AY 15 au Canada, AY 16 au Kenya, AY 17 en Irlande et en Irlande du Nord, AY 19 en Afrique du Sud, AY 21 en Italie et en Suisse, AY.22 au Portugal, AY.24 en Indonésie et AY.23 en Indonésie, à Singapour, au Japon et en Corée du Sud.

=== Autres lignées Delta ===

Un sous-variant du variant Delta est apparu au [[Népal]] avec la mutation {{abréviation |K417N|en position 417, le codon de la lysine (K) est remplacé par l'un de l'asparagine (N)}} déjà présente dans les variants Bêta et Gamma<ref>{{article|nom=Schraer |prénom=Rachel |titre='Nepal variant': What's the mutation stopping green list trips to Portugal? |url=https://www.bbc.com/news/health-57356109 |consulté le=18 juin 2021|périodique=BBC News |date=4 juin 2021}}</ref>. Cette mutation pourrait favoriser l'échappement aux anticorps et donner un risque accru de réinfection<ref>{{article|nom1=Acharya |prénom1=Bhargav |nom2=Jamkhandikar |prénom2=Shilpa |titre=Explainer: What is the Delta variant of coronavirus with K417N mutation? |url=https://www.reuters.com/business/healthcare-pharmaceuticals/what-is-delta-variant-coronavirus-with-k417n-mutation-2021-06-23/ |consulté le=23 juin 2021|périodique=Reuters |date=23 juin 2021}}</ref>. Le variant, appelé « Delta avec K417N » par ''Public Health England'', comprend deux clades correspondant aux lignées Pango AY.1 et AY.2<ref name="briefing17"><!--{{cite techreport-->  {{ lien web | titre=SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England, technical briefing 17 |id=GOV-8576 |institution=Public Health England |date=25 juin 2021|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/996740/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_17.pdf |format=PDF | consulté le=26 juin 2021}}.</ref>. Il a été surnommé « Delta plus »<ref name="briefing17" /> (pour « Delta, plus K417N »<ref>{{article|nom=Cutler |prénom=Sally |titre='Nepal variant': what we've learned so far |url=https://theconversation.com/nepal-variant-what-weve-learned-so-far-162227 |consulté le=18 juin 2021|périodique=The Conversation |date=18 juin 2021}}.</ref>). Le {{date-|22 juin 2021}}, le ministère indien de la santé et du bien-être familial a classé le variant Delta plus comme préoccupant après le signalement de seulement {{nb|22 cas}}<ref>{{article|titre=India says new COVID variant is a concern |url=https://www.reuters.com/world/india/india-reports-42640-new-covid-19-cases-1167-deaths-2021-06-22/ |consulté le=23 juin 2021|périodique=Reuters |date=22 juin 2021|lieu=Bengaluru}}</ref>, ce qui serait prématuré d'après d'éminents virologues<ref>{{article|nom1=Biswas |prénom1=Soutik |titre=Delta plus: Scientists say too early to tell risk of Covid-19 variant |url=https://www.bbc.com/news/world-asia-india-57564560 |consulté le=23 juin 2021|périodique=BBC News |date=23 juin 2021}}</ref>. Début {{date-|2021-07}}, ce variant est présent dans plusieurs pays mais sa diffusion n'est significative qu'au [[Népal]] avec 7 % des séquencements<ref>{{lien web |auteur1=franceinfo |titre=Variant Delta Plus : ce que l’on sait de cette nouvelle souche du coronavirus, détectée dans plusieurs pays do |url=https://www.francetvinfo.fr/sante/maladie/coronavirus/vaccin/variant-delta-plus-ce-que-lon-sait-de-cette-nouvelle-souche-du-sars-cov-2-detectee-dans-plusieurs-pays-dont-la-france_4689635.html |site=[[France Info|francetvinfo.fr]] |date=06-07-2021 |consulté le=19-11-2023}}.</ref>.

Selon [[lignées Pango|Pango]], ses règles de classification de nouvelles lignées<ref><!-- zzz -->https://www.pango.network/the-pango-nomenclature-system/statement-of-nomenclature-rules/</ref> et les classifications AY.1 à AY.3 déjà publiées, les ''sous-lignées'' du variant Delta (c.-à-d. B.1.617.2 ''alias'' AY) comprennent maintenant, au {{date-|2021-08-09}}, les lignées AY.4 à AY.12<ref name="Pango_new-ay-lineages"><!-- zzz -->https://www.pango.network/new-ay-lineages/</ref>. Ces lignées appartiennent au variant Delta, et sont nommées pour faciliter les recherches scientifiques (meilleure granularité génomique, meilleure détermination de répartition géographique)<ref name="Pango_new-ay-lineages" />. Au {{date-|2021-08-27}}, Pango a émis une mise à jour pour les variants AY.4 à AY.12<ref name="Pango_new-ay-lineages" />, introduisant également les lignées AY.13 à AY.25<ref name="Pango_new-ay-lineages-and-an-update-to-ay-4-ay-12">{{lien web |langue=en |titre=Pango.network |url=https://www.pango.network/new-ay-lineages-and-an-update-to-ay-4-ay-12/ |site=pango.network |consulté le=03-06-2024}}.</ref>, lignées appartenant toujours au variant Delta.

== Propagation ==
En {{date-|avril 2021}}, il s'était propagé dans au moins huit pays. Des rapports de terrain le décrivent comme plus contagieux<ref name=":44">{{Lien web |langue=fr-FR |prénom=Par Libération |nom=à 20h59 |titre=Covid : l’Inde, de l’insouciance à la catastrophe |url=https://www.liberation.fr/international/asie-pacifique/covid-linde-de-linsouciance-a-la-catastrophe-20210413_Y46IDPLSDREE7KDFKNQUPGBZO4/ |site=liberation.fr |date=13 avril 2021|consulté le=14 avril 2021}}</ref>. 

Santé publique France écrit le {{date-|8 avril 2021}} : {{Citation|Ce variant a été détecté sporadiquement en [[Angleterre]], [[Allemagne]], au [[Canada]] et à [[Singapour]]. Deux cas ont été détectés en [[Guadeloupe]].}}<ref name=SPF2021-04-08 />

Fin avril, il s'avère que ce variant [[Pandémie de Covid-19 aux Fidji|circule aux Fidji]]. Il y a été apporté par deux patients rapatriés d'Inde. Un soldat en centre de quarantaine a alors été contaminé en touchant leurs bagages. Il a ensuite contaminé une femme de ménage, qui n'a pas informé les autorités de [[Signe clinique|signes cliniques]] de sa maladie et s'est déplacée librement en dehors du centre de quarantaine, contaminant de nombreuses autres personnes<ref>{{en}} [https://www.fbcnews.com.fj/news/covid-19/fiji-announces-more-covid-19-community-infections/ "Fiji announces more COVID-19 local infections"], Fiji Broadcasting Corporation, 27 avril 2021</ref>{{,}}<ref>{{en}} [https://www.fbcnews.com.fj/news/covid-19/variant-confirmed-as-dangerous-india-strain/ "Fiji needs to stop COVID-19 tsunami"], Fiji Broadcasting Corporation, 27 avril 2021</ref>.

Le {{date-|29 avril 2021}}, l'[[agence régionale de santé]] de [[Nouvelle-Aquitaine]] annonce que le variant indien a été détecté pour la première fois en [[France]], dans le département de [[Lot-et-Garonne]], sur un patient revenu d'[[Inde]]. Le lendemain, la [[Direction générale de la Santé]] révèle que deux nouveaux cas ont été détectés dans les [[Bouches-du-Rhône]] et que d'autres cas suspects sont en cours d'investigation dans d'autres régions, concernant toujours des personnes venues d'Inde{{refnec}}.

En {{date-|mai 2021}}, certains médias considèrent que le variant dit indien est plus contagieux que le variant dit britannique. Au [[Royaume-Uni]], le [[VOC-202012/01|variant dit britannique]] ne représente plus que 90 % des virus qui se propagent contre 10 % pour le variant dit indien<ref name="15mai2021_www.lexpress.fr">{{Lien web |titre=L'inquiétude autour du variant indien gagne le Royaume-Uni | langue=fr | url=https://www.lexpress.fr/actualite/monde/infographies-l-inquietude-autour-du-variant-indien-gagne-le-royaume-uni_2150893.html |site=[[L'Express]] |date=15 mai 2021| consulté le=16 mai 2021}}.</ref>.

Au {{date-|8 juin 2021}}, le Royaume-Uni {{incise|pour réagir au variant Delta qui supplante les autres variants}} recommande officiellement de réduire les déplacements au minimum<ref>{{Lien web |langue=en |prénom=Lydia |nom=Stephens |titre=Large area of England told to minimise travel as Delta variant spreads |url=https://www.walesonline.co.uk/news/uk-news/people-large-area-england-told-20766659 |site=WalesOnline |date=08 juin 2021|consulté le=10 juin 2021}}</ref>. En effet, le variant double chaque semaine le nombre de personnes hospitalisées au Royaume-Uni, dont 90% non vaccinées avec deux doses<ref>{{Lien web| url=https://www.lemonde.fr/planete/article/2021/06/18/covid-19-dans-le-monde-l-epidemie-s-emballe-a-moscou-israel-va-transferer-un-million-de-doses-aux-palestiniens_6084682_3244.html |titre=Covid-19 dans le monde : le variant Delta en forte hausse au Royaume-Uni, l’épidémie s’emballe à Moscou| date=18 juin 2021| site=[[Le Monde]]}}</ref>.

En {{date-|juin 2021}}, le variant quintuple chaque quinzaine le nombre de personnes flash-testées en France<ref>[https://www.lemonde.fr/planete/article/2021/06/18/covid-19-en-france-le-variant-delta-est-toujours-minoritaire-mais-en-progression_6084728_3244.html Covid-19 en France : le variant Delta est toujours « minoritaire », mais en progression] ; date=18 juin 2021 ; site=[[Le Monde]].</ref>, c'est-à-dire qu'il est multiplié par {{#expr: sqrt(5) round 1}} chaque semaine. Le {{date-|23 juin 2021}}, [[Gabriel Attal]], porte-parole du gouvernement, annonce que ce variant représente 9 à 10 % des contaminations en France, mais que ce nombre est bien plus élevé dans le département des [[Landes (département)|Landes]] où il atteint 70 %<ref>{{Lien web |langue=fr |auteur=Robin Verner |titre=Selon Gabriel Attal, le variant delta représente 70 % des contaminations dans les Landes |url=https://www.bfmtv.com/politique/selon-gabriel-attal-le-variant-delta-represente-70-des-contaminations-dans-les-landes_AN-202106230286.html |site=bfmtv.com |date=23 juin 2021|consulté le=24 juin 2021}}</ref>.

Toutefois, en France, on recherche des mutations plutôt que des variants<ref>[https://www.ladepeche.fr/2021/06/17/covid-19-pourquoi-ne-cherche-t-on-plus-les-variants-mais-les-mutations-lors-des-tests-9611618.php Covid-19 : pourquoi ne cherche-t-on plus les variants mais les mutations lors des tests ?], ''La Dépêche du Midi'', 17 juin 2021.</ref>. Le {{date-|28 juin}}, la mutation L452R apparaît dans 25,8 % des tests<ref>{{Lien web|url=https://www.capital.fr/economie-politique/les-departements-ou-le-variant-delta-circule-le-plus-notre-carte-de-france-1408397 |site=Capital|titre=Les départements où le variant Delta circule le plus, notre carte de France|auteur=Caroline Robin}}</ref>.

Le {{date-|17 juillet}}, la propagation du variant delta en Espagne conduit au confinement nocturne dans les communes catalanes de plus de {{nb|5000 habitants}}<ref>{{Lien web |langue=fr |titre=Espagne : couvre-feu à Barcelone face à l'explosion des cas avec le variant Delta |url=https://information.tv5monde.com/info/espagne-couvre-feu-barcelone-face-l-explosion-des-cas-avec-le-variant-delta-417185 |site=TV5 Monde |date=16 juillet 2021|consulté le=17 juillet 2021}}.</ref>.

Le lendemain, les [[Pyrénées-Orientales]] {{incise|département français voisin de la Catalogne}} ferme les [[Bar (établissement)|bar]]s, [[restaurant]]s, [[Paillote (construction)|établissements de plage]], [[débits de boissons temporaires]] et [[épicerie]]s de nuit, de 23 h à 6 h<ref>{{Lien web |langue=fr |titre=Covid-19 : fermeture des bars et restaurants à 23h dès dimanche dans les Pyrénées-Orientales |url=https://www.lefigaro.fr/actualite-france/covid-19-fermeture-des-bars-et-restaurants-a-23h-des-dimanche-dans-les-pyrenees-orientales-20210717 |site=Le Figaro |consulté le=17 juillet 2021}}.</ref>.

Le 23 juillet, l'[[région Occitanie|Occitanie]] atteint un taux d'incidence de 200 pour 100 000, et de 651 pour 100 000 chez les 20-29 ans<ref>https://www.ruthenois.com/2021/07/23/covid-19-le-variant-delta-progresse-de-facon-fulgurante-en-occitanie/</ref>.

Au 1 aout 2021, l'[[région Occitanie|Occitanie]] atteint un taux d'incidence de 420 pour 100 000, et de 1200 cas pour 100 000 habitants dans la tranche 20-30 ans<ref>https://www.ladepeche.fr/2021/08/01/alerte-de-lars-doccitanie-ce-que-disent-vraiment-les-chiffres-9708324.php</ref>. Le 4 aout, le [[plan blanc]] est déclenché à Toulouse et en Occitanie<ref>https://actu.fr/occitanie/toulouse_31555/covid-19-le-plan-blanc-declenche-dans-les-hopitaux-de-toulouse-et-d-occitanie_43927158.html</ref>.

=== Problématique liée à l'immunité collective ===
Le professeur [[Jean-François Delfraissy |J-F Delfraissy]] le {{date-|9 juin 2021}} a évalué le [[nombre de reproduction de base]] R<sub>0</sub> du variant Delta à 7,5<ref>{{Lien web|url=https://www.midilibre.fr/2021/06/09/covid-19-une-quatrieme-vague-differente-des-precedentes-pourrait-arriver-a-la-rentree-9595970.php|éditeur=Midi Libre|date=9 juin 2021|consulté le=9 juillet 2021|titre=Covid-19 : une quatrième vague, "différente" des précédentes, pourrait arriver à la rentrée}}</ref>. Le taux d’[[immunité collective]] nécessaire pour que le virus ne se propage plus est donc de <math display="inline">1 - \frac{1}{R_0}</math> soit 87 %.

=== Efficacité des vaccins avec le variant Delta ===
L'efficacité des vaccins diminue avec le variant Delta.  D'après des études britanniques<ref>{{Lien web|url=https://www.gov.uk/government/news/vaccines-highly-effective-against-b-1-617-2-variant-after-2-doses|titre=Vaccines highly effective against B.1.617.2 variant after 2 doses |éditeur=Public Health England|date=21 mai 2021|consulté le=21 juillet 2021}}</ref>{{,}}<ref name="eff"/> et canadiennes<ref name="canada"/>, celle-ci est :
{| class="wikitable alternance center"
 |+ Efficacité des vaccins contre le variant Delta<ref name="eff">{{Lien web|date=21 juillet 2021|titre=Covid-19 : voici à quelle condition le vaccin de Pfizer est très efficace contre le variant Delta |url=https://www.businessinsider.fr/covid-19-voici-a-quelle-condition-le-vaccin-de-pfizer-est-tres-efficace-contre-le-variant-delta-188211 |site=Business Insider}}</ref>
 |-
 ! scope="col" | Vaccin
 ! scope="col" | Après 1 injection
 ! scope="col" | Après 2 injections
 |-
 ! scope="row" | AstraZeneca
 | style="text-align: center;" |30%
 | style="text-align: center;" |67%
 |-
 ! scope="row" | Pfizer-BioNTech
 | style="text-align: center;" |36%
 | style="text-align: center;" |88%
 |-
 ! scope="row" | Moderna
 | style="text-align: center;" |72%<ref name="canada">{{Lien web|date=08 juillet 2021|titre=Voici l'efficacité des vaccins Covid-19 contre le variant Delta, selon les meilleures études |url=https://www.businessinsider.fr/voici-lefficacite-des-vaccins-covid-19-contre-le-variant-delta-selon-les-meilleures-etudes-188073 |site=Business Insider}}</ref>
 | style="text-align: center;" |n.d.
|}

== Détection ==
Lors d'un [[Test diagnostique du SARS-CoV-2|test RT-PCR]], le variant Kappa peut être distingué notamment par la mutation E484Q. La mutation L452R, quant à elle, permet de distinguer aussi bien le variant Kappa que le variant Delta<ref>{{Lien web |langue=fr |titre=Le point sur les variants du Coronavirus Covid19 |url=https://www.cerballiance.fr/fr/blog/actualites/le-point-sur-les-variants-du-coronavirus-covid19 |site=cerballiance.fr |consulté le=19 décembre 2021}}</ref>.

== Notes et références ==
=== Notes ===
{{ références | groupe="Note"}}

=== Références ===
{{références nombreuses|taille=24}}

=== Liens externes ===
* {{lien web | langue=es |url=https://www.france24.com/es/am%C3%A9rica-latina/20210901-covid-19-oms-variante-mu-colombia-vacunas | titre=L'OMS inclut la variante Mu dans sa liste d'intérêt sur COVID-19 | consulté le=5 septembre 2021 | date=1 septembre 2021 | site = [[France24]]}}.

{{Palette|SARS-CoV-2|Pandémie de Covid-19}}
{{Portail|coronavirus 2019|Inde}}

[[Catégorie:Variant du SARS-CoV-2|Delta]]