Cofacteur F430
Modèle:Infobox Chimie Le cofacteur Modèle:Fchim est le groupement prosthétique de la méthyl-coenzyme M réductase, une enzyme intervenant à la dernière étape de la méthanogenèse chez les archées méthanogènes pour libérer le méthane :
- CoB–SH + [[Méthyl-coenzyme M|Modèle:Fchim]] → CoB–S–S–CoM + [[Méthane|Modèle:Fchim]].
Ce cofacteur doit son nom à son maximum d'absorption à Modèle:Nobr.
Structure
Le cofacteur Modèle:Fchim isolé est thermiquement instable et sensible à l'oxydation. Sa structure a été déterminée par cristallographie aux rayons X et spectroscopie RMN[1]. Il possède seulement cinq double liaisons, ce qui en fait le tétrapyrrole naturel le plus réduit.
La forme active du Modèle:Fchim contient le cation Ni(I), de façon analogue au cofacteur [[Vitamine B12|Modèle:Fchim]] qui contient le cation Co(I). Ces deux ions ont néanmoins une configuration électronique différente : Co(I) est diamagnétique avec une configuration en d8 tandis que Ni(I) est paramagnétique avec une configuration en d9. Modèle:Fchim est le seul tétrapyrrole biologique connu fonctionnant avec du nickel.
Il existe une variante du Modèle:Fchim thiométhylée sur le carbone 172, ce qui ne semble pas altérer les propriétés réactionnelles du cation Modèle:Nobr
Mécanisme proposé
Le mécanisme de clivage de la liaison Modèle:Fchim dans la méthyl-coenzyme M n'est pas complètement élucidé, bien qu'il soit établi que la Modèle:Nobr et la Modèle:Nobr s'insèrent sur la méthyl-coenzyme M réductase dans un canal terminé par le Modèle:Nobr, sur un site axial du nickel. Il est possible que Ni(I) transfère un électron au méthyle Modèle:Fchim pour former le méthane Modèle:Fchim en laissant le nickel à l'état d'oxydation Ni(II) ; ce dernier est ensuite à nouveau réduit à l'état Ni(I) au moment du clivage de la liaison Modèle:Fchim de la Modèle:Nobr par la Modèle:Nobr[2].
Notes et références
- ↑ Modèle:En G. Farber, W. Keller, C. Kratky, B. Jaun, A. Pfaltz, C. Spinner, A. Kobelt, A. Eschenmoser, « Coenzyme Modèle:Fchim from Methanogenic Bacteria: Complete Assignment of Configuration Based on an X-ray Analysis of 12,13-diepi-F430 Pentamethyl Ester and on NMR Spectroscopy », dans Helvetica Chimica Acta 1991, 74, 697-716.
- ↑ Modèle:En C. Finazzo, J. Harmer, C. Bauer, B. Jaun, E. C. Duin, F. Mahlert, M. Goenrich, R. K. Thauer, S. Van Doorslaer et A. Schweiger, « Coenzyme B Induced Coordination of Coenzyme M via Its Thiol Group to Ni(I) of Modèle:Fchim in Active Methyl-Coenzyme M Reductase », dans Journal of the American Chemical Society, 2003, 125, 4988-4989.